Каковы могут быть последствия и являеся ли нарушением если доп. работы по "черновой отделке" включены в договор позже "чистовых работ": чистовые работы по Кс-2 прошли в июле,черновые- оформлены к октябрю,документы заменять нельзя.

Цифра, Вообще-то конечно нарушение. Но тут главное чтобы ИП была правильно оформлена! Обязательно акты на скрытые работы были подписаны раньше, чем закрыта чистовая отделка. И в журналах работ чтобы всё было записано. Остальное объяснимо всё.